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Revue Internationale de Géomatique

1260-5875
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International Journal of Geomatics and Spatial Analysis
 

 ARTICLE VOL 18/2 - 2008  - pp.215-237  - doi:10.3166/geo.18.215-237
TITRE
Un rôle pour la science de l'information géographique en écologie moléculaire La détection de régions du génome soumises à la sélection naturelle

RÉSUMÉ
Cet article présente une méthode d'analyse spatiale originale basée sur le concept de coïncidence spatiale et sur le calcul simultané de nombreuses régressions logistiques dont le rôle est de détecter des régions du génome soumises à la sélection naturelle. Son application permet d'identifier les mêmes régions que celles mises en évidence par une approche théorique en génomique des populations et, en outre, d'identifier les paramètres environnementaux responsables de la sélection, ce qui était difficilement faisable jusqu'ici. Cette recherche ouvre des perspectives d'applications pour la science de l'information géographique en écologie moléculaire.


ABSTRACT
We introduce a new method to detect signatures of natural selection in the genome based on the application of spatial analysis, with the contribution of Geographical Information Systems, environmental variables, molecular data, and multiple univariate logistic regressions. Its use allows the identification of the same genomic regions as revealed by a theoretical approach in population genomics, but also the uncovering of environmental parameters responsible for selection which was so far difficult. This research also opens up avenues for GIScience research in molecular ecology.


AUTEUR(S)
Stéphane JOOST, Aurélie BONIN, Pierre TABERLET, Régis CALOZ

MOTS-CLÉS
analyse spatiale, science de l'information géographique, écologie moléculaire, génomique environnementale, sélection naturelle.

KEYWORDS
spatial analysis, GIScience, molecular ecology, landscape genomics, natural selection.

LANGUE DE L'ARTICLE
Français

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